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毒素（Toxins），一般指人體外毒素，有別于人體自身在糖、蛋白質、脂肪代謝過程中產生的內毒素，外毒素指外在環境的環境污染帶來的有害物質，如空氣污染、水污染、食品污染、化學藥品的毒副作用、病原微生物（細菌、病毒等）。

生物毒素（Biotoxins）是生物在生長和代謝過程中產生的有毒化學物質（Poisons），有蛋白毒素和非蛋白毒素，根據其產生的來源可分為：

植物毒素（Phytotoxins），如蓖麻毒素、相思豆毒素、蒴蓮根毒素等；

細菌毒素（Bacterial toxins)，又稱微生物毒素（Microbial Toxins），如白喉毒素、霍亂毒素、肉毒毒素、破傷風毒素、葡萄球菌毒素等；

動物毒素（Venom），如蛇毒、蜘蛛毒、蛙毒、蝎毒、蜂毒、蟻毒、蜈蚣毒、河豚毒素等；

霉菌毒素，又稱真菌毒素（Mycotoxins），如黃曲霉素、赭曲霉素、玉米赤霉醇、麥角毒素、毒蕈毒素-蠅蕈堿、鵝膏蕈堿等。

海洋毒素（Marine Toxins），海洋生物體產生的毒素，根據毒性作用特征可分為腹瀉性貝類毒素(Diarrhetic Shellfish Poisoning，DSP)、麻痹性貝類毒素(Paralytic Shellfish Poisoning，PSP)、神經性貝類毒素(Neurotoxic Shellfish Poisoning， NSP)和記憶缺損性貝類毒素(Amnesic Shellfish Poisoning， ASP)等。重要的海洋毒素有河豚毒素、石房蛤毒素、肉毒魚毒素、沙海葵毒素、海兔毒素、魚腥毒素、海參毒素和沙蠶毒素等，不但具有強烈的毒性，而且具有廣譜的藥理效應。